Développeur/spécialiste de données médicales
Top Benefits
About the role
Une équipe du CHU Sainte-Justine
Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications et technologies que notre équipe développe, servent à optimiser l'utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l'amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.
Analyste de données
Nous recherchons un développeur spécialiste de données médicales pour travailler au sein de l’équipe de la plateforme de mégadonnées (UniC) qui intègre l’ensemble des données clinico-administratives générées par l’hôpital. Cette plateforme est constituée d’un lac de données alimenté par les différents systèmes hospitaliers, ainsi qu’une gamme d’outils analytiques performants adaptés à la science des données massives.
Votre rôle
Vous êtes autonomes et prenez vos responsabilités à cœur. Positif, créatif et ouvert aux idées nouvelles, vous faites preuve de flexibilité afin de réaliser votre mission.
En tant que membre de l’équipe Ferlab, vous rôle consistera à :
Construire des pipelines ETL Extract, Transform, Load) pour enrichir l'entrepôt de données et développer des jeux de données pour la recherche. Harmoniser des données hétérogènes en appliquant des standards tels que le modèle OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) et/ou le standard FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) et faire le mappage de terminologies médicales vers des référentiels internationaux standardisés (ex: CIM-10, SNOMED, LOINC). Collaborer avec les chercheurs du CHUSJ et de d'autres établissements pour préparer et analyser des jeux de données. Utiliser des modèles d'IA générative (LLM) afin d'extraire et standardiser les données médicales à partir des notes cliniques ou autres sources de données non-structurées. Préparer et documenter les spécifications requises pour l’élaboration des jeux de données. Appliquer des transformations de données quantitatives, notamment la normalisation des données. Assurer la qualité des données.
Notre stack technique
Nous privilégions l’utilisation de logiciels Open Source, publiés sur GitHub et sommes toujours ouverts à explorer de nouvelles technologies et façons de faire. Nous travaillons avec les langages Scala, Python et R. Nous utilisons les plus récentes technologies telles que, par exemple, Airflow, Delta lake et Iceberg, ElasticSearch, PostgreSQL, S3 (Minio).
Nous Cherchons Une Personne Ayant
Un diplome universitaire en informatique, statistique ou domaine équivalent Une connaissance des données hospitalières et de la nomenclature et codage des diagnostics et procédures médicales De l’expérience dans l’application d'approches de l'intelligence artificielle dont l’optimisation des performances des modèles de langage et l'application d'instructions génératives avancées. De l’expérience en langages Python, R, Scala ou autres. De l'expérience avec le versionnage de code (Git). De l’expérience avec AWS ou autre plateforme infonuagique et object stores S3 De la facilité à travailler dans un environnement agile et collaboratif De bonnes habiletés de communication (Français et Anglais) Proactif et débrouillard, être capable de se mettre en mode solution!
Conditions
Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse !
35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines 9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) 13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) Fonds de pension généreux – l’un des meilleurs sur le marché Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel Possibilité de télétravail Environnement de travail Linux ou Mac à votre choix. La maîtrise du français, tant à l'oral qu'à l'écrit, est essentielle pour ce poste.
Joignez-vous à nous et mettez vos compétences au service de la santé des enfants. Postulez par courriel au carrieres@ferlab.bio.
About FerLab - Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
FerLab is a new team in software development at the CHU Sainte-Justine Research Center under the supervision of Dr. Vincent Ferretti.
Our software development team is an essential support for the progress of genomic and biomedical research. Ferlab's objective is to develop new applications and technologies that optimize the use of massive health data for research and thus contribute to the improvement of treatments and diagnoses for young patients at the CHU Sainte-Justine and everywhere in the world.
To learn more about the technologies we use and the culture of the team, consult the Github repositories: Ferlab Ste-Justine
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Composé de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l’un des plus importants en Amérique. Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions médicales graves, les applications et technologies que notre équipe développe, servent à optimiser l'utilisation des données massives de santé pour la recherche et ainsi contribuer à l'amélioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.
Analyste de données
Nous recherchons un développeur spécialiste de données médicales pour travailler au sein de l’équipe de la plateforme de mégadonnées (UniC) qui intègre l’ensemble des données clinico-administratives générées par l’hôpital. Cette plateforme est constituée d’un lac de données alimenté par les différents systèmes hospitaliers, ainsi qu’une gamme d’outils analytiques performants adaptés à la science des données massives.
Votre rôle
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En tant que membre de l’équipe Ferlab, vous rôle consistera à :
Construire des pipelines ETL Extract, Transform, Load) pour enrichir l'entrepôt de données et développer des jeux de données pour la recherche. Harmoniser des données hétérogènes en appliquant des standards tels que le modèle OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) et/ou le standard FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) et faire le mappage de terminologies médicales vers des référentiels internationaux standardisés (ex: CIM-10, SNOMED, LOINC). Collaborer avec les chercheurs du CHUSJ et de d'autres établissements pour préparer et analyser des jeux de données. Utiliser des modèles d'IA générative (LLM) afin d'extraire et standardiser les données médicales à partir des notes cliniques ou autres sources de données non-structurées. Préparer et documenter les spécifications requises pour l’élaboration des jeux de données. Appliquer des transformations de données quantitatives, notamment la normalisation des données. Assurer la qualité des données.
Notre stack technique
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Nous Cherchons Une Personne Ayant
Un diplome universitaire en informatique, statistique ou domaine équivalent Une connaissance des données hospitalières et de la nomenclature et codage des diagnostics et procédures médicales De l’expérience dans l’application d'approches de l'intelligence artificielle dont l’optimisation des performances des modèles de langage et l'application d'instructions génératives avancées. De l’expérience en langages Python, R, Scala ou autres. De l'expérience avec le versionnage de code (Git). De l’expérience avec AWS ou autre plateforme infonuagique et object stores S3 De la facilité à travailler dans un environnement agile et collaboratif De bonnes habiletés de communication (Français et Anglais) Proactif et débrouillard, être capable de se mettre en mode solution!
Conditions
Nous vous offrons des conditions qui s'harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non l’inverse !
35 heures semaine – vous aurez une grande flexibilité dans votre horaire Sélection libre des vacances – vous débutez avec 4 semaines 9.6 jours de congés maladie payés (3 en journées personnelles) 13 jours fériés - au lieu de 10 (tel que prévu par la CNESST) Fonds de pension généreux – l’un des meilleurs sur le marché Un régime d’assurance collective et un programme d’aide aux employés – pour vous et votre famille Une garderie sur place – pour les parents qui souhaitent travailler en présentiel Possibilité de télétravail Environnement de travail Linux ou Mac à votre choix. La maîtrise du français, tant à l'oral qu'à l'écrit, est essentielle pour ce poste.
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About FerLab - Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
FerLab is a new team in software development at the CHU Sainte-Justine Research Center under the supervision of Dr. Vincent Ferretti.
Our software development team is an essential support for the progress of genomic and biomedical research. Ferlab's objective is to develop new applications and technologies that optimize the use of massive health data for research and thus contribute to the improvement of treatments and diagnoses for young patients at the CHU Sainte-Justine and everywhere in the world.
To learn more about the technologies we use and the culture of the team, consult the Github repositories: Ferlab Ste-Justine